TILS210: ELINAIKAMALLIT (2-5op):

Kurssilla esitellään elinaika-aineiston peruskäsitteitä kuten välttöfunktio, vaarafunktio ja kumulatiivinen vaarafunktio. Näiden estimointia käsitellään luokittelemattomien, luokiteltujen ja sensuroitujen havaintojen tapauksissa. Välttöfunktioiden estimointiin ja vertailuun käytetään parametrittomia, semiparametrisia ja parametrisia menetelmiä (esim. elinaikataulukot, Kaplan-Maierin estimaatit, rank-testit, Coxin suhteellisen vaaran malli, parametriset mallit, jne.). Menetelmien käyttöä harjoitellaan SAS- ja R-ohjelmistojen avulla.

Tilastotieteen pääaineopiskelijoille kurssi on 5 op laajuinen. Kurssin arvosana määräytyy tällöin harjoitustehtävien, tentin ja harjoitustyön perusteella. Muut opiskelijat voivat suorittaa kurssin joko 5 op tai 2 op laajuisena. Kahden opintopisteen kurssin arvosana määräytyy harjoitustehtävien ja harjoitustyön avulla.

Tilastotieteen pääaineopiskelijoilla esitiedoiksi vaaditaan kurssit Tilastollinen päättely 1 ja 2, Yleistetyt lineaariset mallit 2 ja R-kurssi. Muilla opiskelijoilla esitiedoiksi riittävät Data ja mittaaminen tai tilastomenetelmien peruskurssi sekä valmiudet R-ohjelmiston käyttöön.

Kurssin luentokalvot, harjoitustehtävät sekä niiden ratkaisut jaetaan Kopassa. Kurssilla käytettävät aineistot ladataan kurssin kotisivuilta.

Aikataulu:

Luennot 8.1. alkaen ja demot 17.1. alkaen:

  • ke klo 14:15-16 salissa MaD206 tai MaD353 (luennot/harjoitukset kaikille)
  • to klo 10:15-12 salissa MaA210 (luennot 5op suorittajille)
  • pe klo 8:30-10 salissa MaD205 (demot kaikille)

Keskiviikon ja perjantaina tunnit järjestetään tietokoneluokassa. Jos haluat tehdä harjoituksia omalla kannettavalla, varmista, että R-ohjelmisto on käytössä ennen ensimmäistä tuntia. Asennus Windows-koneelle onnistuu seuraavien ohjeiden mukaisesti (ks. ohjeet muihin käyttöjärjestelmiin ao. linkistä):

  • Siirry R:n materiaaliarkistosivulle: http://cran.r-project.org/index.html
  • Valitse: "Download R for Windows"
  • Valitse: "install R for the first time"
  • Valitse: "Download R X.X.X for Windows"
  • Tallenna aukeava tiedosto omalle tietokoneelle.
  • Avaa tallentamasi tiedosto (tämä vaihe vaatii riittäviä käyttöoikeuksia, ts. käytössäsi pitää olla ns. "järjestelmänvalvojan käyttäjätili".
  • Noudata asennusohjelman ohjeita vaihe vaiheelta:
    • Valitse kieli.
    • Voit mm. valita oman asennushakemiston ja muita asetuksia, tai klikata jokaisessa vaiheessa vain "Seuraava/Next".
    • Voit mm. valita, tuleeko R-kuvake työpöydälle ja/tai pikakäynnistyspalkkiin (alalaitaan), josta ohjelma aukeaa.
  • Avaa R jostakin asentamastasi kuvakkeesta.

Kirjallisuutta:
  • Collett, D. (2003). Modelling Survival Data in Medical Research, Chapman and Hall, London.
  • Kalbfleisch, J.D. and Prentice, R.L. (1980). The Statistical Analysis of Failure Time Data, Wiley, New York.
  • Lee, E.T. (1992). Statistical Methods for Survival Data Analysis, Wiley, New York.